Diagnóstico molecular de enfermedades raras en el Instituto Nacional de Salud del Niño (sede Breña) en el periodo 2014-2017

Abstract

El Servicio de Genética y Errores Innatos del Metabolismo (SGEIM) del Instituto Nacional de Salud del Niño (INSN) se encarga del diagnóstico y tratamiento de las enfermedades genéticas que aquejan a niños entre 0-17 años, a nivel nacional. A fines del 2014, era evidente que se requería la implementación de pruebas moleculares para el diagnóstico de enfermedades raras. Inicialmente, las enfermedades que se priorizaron para la búsqueda de diagnóstico molecular fueron: X-frágil, atrofia muscular espinal (AME) y desórdenes sexuales asociados a la presencia o ausencia del gen SRY. Las pruebas se implementaron y validaron utilizando las técnicas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de punto final y electroforesis. Posteriormente, se implementaron pruebas moleculares para el diagnóstico de acondroplasia y el síndrome de Muenke, entre otras, mediante técnicas de PCR, digestión enzimática y electroforesis. En el año 2015, ingresaron al INSN-Breña los equipos en “cesión en uso” necesarios para realizar la prueba de diagnóstico mediante CMA (chromosome microarray analysis) para detectar rearreglos cromosómicos menores de 5 Mb, que no pueden detectarse mediante la prueba de cariotipo convencional. Con esta plataforma, el INSN se convirtió en la primera entidad pública a nivel nacional en realizar este tipo de examen. Además, se logró que la mayoría de las pruebas ofrecidas fueran cubiertas por el SIS, poniéndolas a disposición de toda la población asegurada, lo cual se tradujo en el crecimiento del número de muestras. Mi trabajo en el período 2014-2018 no sólo consistió en la parte de implementación y análisis de pruebas, sino que también tuvo un fuerte componente logístico y administrativo. Luego de mi partida, en el 2018, el Laboratoriosiguió ofreciendo las pruebas moleculares establecidas y además implementaron la técnica de secuenciamiento exómico (WES), adquiriendo los equipos respectivos en “cesión en uso”y obteniendo el entrenamiento necesario para el análisis bioinformático. Debido a este progreso, el laboratorio de Biología Molecular del SGEIM cuenta en la actualidad con una cartera de servicios de aproximadamente 10-12 pruebas moleculares, todas cubiertas por el SIS, y realizadas por 4 biólogos calificados.

The Servicio de Genética y Errores Innatos del Metabolismo (SGEIM) from the Instituto Nacional de Salud del Niño (INSN) oversees the diagnosis and treatment of genetic diseasesthat affect children between 0-17 years, nationwide. By the end of 2014, the need for the implementation of molecular tests for the diagnosis of rare diseases was evident. Initially, the following diseases were prioritized for the search of molecular diagnosis: fragile X syndrome, spinal muscular atrophy, and sexual disorders associated with the presence or absence of SRY. The first tests were developed, implemented, and validated using techniques such as endpoint polymerase chain reaction (PCR) and electrophoresis. Later, molecular tests for the diagnosis of achondroplasia and Muenke syndrome, among others,were implemented using techniques such as endpoint PCR, enzymatic digestion, andelectrophoresis. In 2015, the Institute welcomed all the necessary devices to perform CMA (chromosome microarray analysis), a test that can detect chromosomal rearrangements under 5 Mb, which cannot be detected by conventional karyotyping. With this platform, the INSN became the first public institution to offer this kind of test. Moreover, we achieved for most of the tests to be covered by SIS, making them available for the entire paediatric population covered by this kind of insurance. This was translated into an increase in the number of samples received. My work between the years 2014 and 2018 not only involved the implementation and analysis of tests, but had also a strong logistical and administrative component. After my departure, in 2018, the laboratory continued offering the molecular tests previously established, and further expanded via the implementation of next generationsequencing (WES). Due to this progress the SGEIM molecular biology laboratory, to date, offers approximately 10-12 diagnostic tests, all covered by SIS, and performed by 4 qualified biologists.